2017年12月，馬克思主義理論校級重點建設學科正式設立。馬克思主義理論學科自設立以來，積極開展學科建設工作，凝練學科方向、打造學科團隊、構筑學科平臺，提升重點學科的師資隊伍水平、科研實力、人才培養質量和服務地方經濟社會發展能力。
馬克思主義理論學科圍繞服務安徽省“三地一區”建設和巢湖學院“十四五”發展規劃，以重大現實問題為導向，以思想政治理論課為依托，進一步凝練學科方向，形成馬克思主義基本原理研究、馬克思主義中國化理論與實踐研究、中華優秀傳統文化與思想政治教育研究、中國近現代史基本問題研究四個相對穩定的學科方向，形成課程建設與學科建設相互促進、特色鮮明的馬克思主義理論學科體系。
馬克思主義理論學科擁有一支理論功底扎實、綜合素質優良、具有奉獻精神的教師隊伍?，F有學科成員49人，其中教授4人，副教授20人，博士18人，在讀博士2人。根據學科研究需要，設“鄉村治理研究所”“中華優秀傳統文化和思想政治教育”校級研究機構。擁有安徽省教學團隊2個、弘揚社會主義核心價值觀名師工作室6個、校級科研創新團隊1個。
馬克思主義理論學科堅持走“特色鮮明、質量優先、內涵發展”的學科發展道路，著力提高馬克思主義理論研究與教學的創新能力。近五年來，選派教師參加相關學術會議100余場，邀請校內外專家學者作學術報告50余場，舉辦10期“湯山思政講堂”，為教師搭建專業成長和教科研能力提升的平臺。獲立國家社會科學基金項目5項、教育部人文社會科學重點研究基地重大項目1項、教育部人文社會科學研究項目3項、安徽省哲學社會科學規劃項目2項、安徽省教育廳人文社會科學研究重大項目1項、安徽省教育廳人文社會科學研究重點項目8 項、安徽省高校思想政治工作能力提升計劃項目9項、省級思政課“精彩一課”2項。榮獲安徽省教學成果二等獎、三等獎各1項。公開發表學術論文150余篇，出版專著和編寫教材數部。
馬克思主義理論學科高度重視開展理論宣講和社會服務工作。近五年來，先后為巢湖市直機關、安巢經開區稅務局、皖維集團公司等機關企事業單位開展理論宣講200余場，受眾近4萬人，受到邀請單位的充分肯定和普遍歡迎，產生了較為廣泛的社會影響。2023年，巢湖學院“主旋律”思政隊伍宣講團入選團中央全國重點高校講師團宣講矩陣。學院堅持“立足合肥市、扎根環巢湖、服務安徽省、融入長三角”服務面向，承辦2022年度阜陽市潁東區村（社區）書記鄉村振興培訓班、2022年度巢湖市直機關國有企業黨建業務培訓班、2022年度第一期全省基層宗教工作干部培訓班，2023年度東鑫集團能力提升培訓班、2023年度甘肅嘉峪關市黨外干部培訓班，產生了良好的社會反響。
未來，馬克思主義理論學科將堅持走“特色鮮明、質量優先、內涵發展”的學科發展道路，進一步凝聚學科成員干事創業精氣神，自我加壓持續用力，奮力譜寫學科發展的新篇章。